新規ゲノム編集ツール TiD

TiDとは？

CRISPRシステムは、獲得免疫の応答に働くCasタンパク質の多様性から、6タイプ33種以上のサブタイプに分類されています。
徳島大学：刑部博士は微生物メタゲノムより、TypeI-D(TiD) をゲノム編集ツールとして同定しました。
TiDは、他のCas因子よりgRNAが長く(35 ～ 36塩基)、標的特異性が高いという特徴から、CRISPR/Cas9で懸念されることの多いオフターゲット候補総数を大幅に減少させることができる他、標的配列の上流・下流方向に数kb以上の長鎖欠失を引き起こすことも、小規模なindel変異を誘導することも可能となっています。

TiDは商用利用が可能！

これまで、CRISPR/Cas9を用いたゲノム編集を行う場合、商用利用の際には特許関係が煩雑でした。TiDは徳島大学が単独で特許を出願しております。*
*特願2017-158876

本特許の動物分野における独占的実施権を保有している、大塚製薬工場様と別途契約する事で商用利用が可能です。

セツロテックでできること

セツロテックでは、以下のようなサービスを展開予定です！

＊ゲノム編集用のTiDベクターの作製
＊ TiDを用いたゲノム編集用gRNAの作製
＊ TiDを用いたノックアウト細胞の作製
＊ TiDを用いたノックアウト細胞の作製＋CROサービス
例：発現解析サービス(Western Blot等)、細胞増殖解析　等

詳細は弊社担当営業までお問い合わせくださいませ。

他のCas因子との比較

	Cas9 (class2,type-II)	Cas3 (class1,typeI-E)	TiD (class1, typeI-D)
ヌクレアーゼ	Cas9 (endonuclease)	Cas3e (helicase and nuclease)	Cas10d (helicase, nuclease)
gRNA	20塩基	32塩基	35-36塩基
PAM	NGG	AAG, AGG	GTA, GTC, GTT
変異	短い塩基欠失/挿入	標的5’側の長鎖欠失	短い塩基欠失/挿入 ＋双方向の長鎖欠失
オフターゲット効果*	ある程度はある	Cas9よりは少ない	かなり少ない

*任意のOn-targetに対するoff-targe部位を網羅的にin-silico抽出し、0塩基-5塩基ミスマッチのoff-taget候補総数を比較の結果

(画像は徳島大学　刑部博士よりご提供)

ご用意いただく情報・サンプル

ゲノム編集培養細胞作製の流れ