NGS解析 （アンプリコンのNGS解析）

アピールポイント

試料をお送りいただくだけでアンプリコン解析が可能。1st PCR産物や、DNA抽出物をお送りいただくこともできます。

CRISPRやshRNAなどによる大規模スクリーニングでの配列決定等に

ゲノム編集効率確認や、多様性解析などに

16S rRNAや18S rRNA配列解析による種同定に

ペアエンド解析で最大600bp (300bp x2)

１サンプルにつき3-5万リードペア程度

まとめて解析することでよりリーズナブルに

NGS解析（アンプリコンのNGS解析）

PCR増幅したDNA断片をIllumina NGSで解析します。CRISPR-CasやshRNAを利用したスクリーニングで、crRNA配列やshRNA配列の頻度解析が可能です。また、細菌16S rRNA配列や真核生物18S rRNA配列の解析で生物種解析ができます。その他、ゲノム編集効率や特定領域の多様性解析など、ショートリードディープシークエンサーを用いることで幅広い解析が可能です。

ご提供いただくサンプル／情報

試料から

・培養細胞 10^5細胞
（※BSL2まで対応。感染細胞である旨はお知らせください）
・組織断片 100mg以上
・プライマー配列（既に決まっている場合）
※土壌・糞便・腸管内容物等の場合、事前にご相談ください。
※感染性のあるサンプルや、その他弊社が受け入れ困難と判断した場合、お断りすることがあります。

抽出したDNA

・0.5 ng/uL以上のDNA溶液で、液量20 uL以上 が望ましい。
・目的の配列情報
・プライマー配列（既に決まっている場合）

1st PCR産物

・精製前の1st PCR産物（15 uL以上）
　　: 目的の増幅産物があることをご確認ください。
（電気泳動図等をご提供ください。）
・増幅断片のサイズ
・1st PCRに用いたプライマー配列

仕様：納品物・目安納期・価格

オプション・関連サービス