微生物シングルセルゲノム解析
マイクロバイオームを1細胞レベルで解析
• 微生物叢の個々の菌が持つ機能を知る • メタゲノムで解析が困難な近縁種も解析 • 個々の微生物のプラスミド、ファージ配列も精緻に解析
サービス概要
bitBiomeが独自で提供する、微生物を対象としたシングルセルゲノム解析サービスです。 微生物ゲノムを培養することなく、高解像度な解析が可能になります。 土壌や糞便など検体を送るだけでゲノム情報から遺伝子まで一式の解析結果が得られます。 【シングルセルゲノム解析の特徴】 ・培養不要なプロセス これまで培養条件検討に時間がかかっていた微生物や発育が遅い微生物など、難培養性微生物の高精度な機能解析が可能になります。 ・解析困難なサンプルにも適用 DNA量が少ない、人由来などのホストDNAのコンタミが多いといった従来のメタゲノム解析では解析が難しい検体も解析可能です。多様な検体で高精度なゲノム解析や、新規微生物の探索が実現できます。 ・株レベルの高解像度解析 従来のメタゲノム解析では属・種レベルまでしか得られない情報もシングルセルゲノム解析が株レベルの解像度で実現できます。菌叢中のプラスミド/ファージと宿主との紐づけも可能になります。 【基本データ解析内容】 ・アセンブリ・ゲノム構築 ・生物系統推定 ・遺伝子推定
【シングルセルゲノム解析フロー】 環境微生物、腸内細菌、病原微生物、薬剤耐性菌も、従来法では培養・解析困難な細菌の高精度な機能解析を実現。
サービス種類
| 解析メニュー | 作業内容 | データ量 | 単価(税別) | 納期送付 | サンプル例 |
|---|---|---|---|---|---|
| お試しコース | 検体処理、 droplet封入、 シーケンシング、 基本データ解析 | 1プレート：20Gb | ¥450,000 | 6週間 (30営業日) | 糞便、皮膚、唾液、プラーク、土壌、温泉、海水、汚泥、メタン発酵液、細菌懸濁液 ※その他のサンプル種もご相談ください |
| 推奨コース | 1プレート：30Gb | ¥580,000 | |||
| 増し増しコース | 3プレート：100Gb | ¥1,000,000 (初回) |
備考
