原核生物RNA-seq解析
rRNAを除去し、発現の本質を捉える
✓ 全ての作業を「国内ラボ」で実施の安心体制 ✓ 多様な検体の「RNA抽出から」対応可能です
サービス概要
RNAサンプルからrRNAを除去し、次世代シーケンスでバクテリアを対象とした網羅的遺伝子発現解析を行います。 サンプルからのRNA抽出からデータ解析まで柔軟なご依頼が可能なサービスです。 4検体以上でのご依頼でスタンダード解析が無料に！
サービス種類
| メニュー | データ量／リード数 | 標準納期※ | サンプル要件 | 価格（税別） |
|---|---|---|---|---|
| 原核生物RNA-seq (rRNA除去) | 1.5Gb／10M read | 30営業日 | 濃度50ng/μL以上で≧20μL以上 (総量：1μg以上) RIN値≧7推奨 | ¥38,000 |
| 原核生物RNA-seq (rRNA除去・RNA抽出) | 35営業日 | 細菌株サンプル （1.0×109 cells 推奨） | ¥53,000 |
※標準納期はサンプル受領後の期間となります。
報告内容
解析なし： シーケンス生データ 解析あり： ①シーケンス生データ ②マッピングとカウント結果 ③各種解析結果と解析レポート
オプション
| スタンダード解析Plan | アドバンス解析Plan | カスタマイズ解析Plan |
|---|---|---|
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1. データQC 2. リードマッピング 3. リードカウント 4. FPKM値/TPM値算出 |
1. スタンダード解析 2. 相関分析 3. 主成分分析 4. 階層的クラスタリング 5. ヒートマップ描画 6. 変動遺伝子解析(MA plot, Volcano plot) |
パスウェイ解析、融合遺伝子解析、 Transcript SNP解析、 de novo transcriptomeなど、 ご要望に応じて各種対応します。 |
※ 対象生物ゲノム情報の提出・指定などはご相談になります。