真核生物RNA-seq解析
mRNAを捉え、発現の全体像を解き明かす
✓ 全ての作業を「国内ラボ」で実施の安心体制 ✓ ヒト・マウスから細菌など多様な検体の「RNA抽出から」対応可能です
サービス概要
真核生物のmRNAをPolyA選択法で濃縮して、次世代シーケンスで網羅的遺伝子発現解析を行います。 サンプルからのRNA抽出からデータ解析まで柔軟なご依頼が可能なサービスです。 4検体以上でのご依頼でスタンダード解析が無料に！
サービス種類
| メニュー | データ量／リード数 | 標準納期※ | サンプル要件 | 価格（税別） |
|---|---|---|---|---|
| 真核生物RNA-seq | 6Gb／40M read | 30営業日 | 濃度50ng/μL以上で≧20μL以上 (総量：1μg以上) RIN値≧7推奨 | ¥40,000 |
| 真核生物RNA-seq (RNA抽出有) | 35営業日 | ヒト, マウスなど その他もご相談ください | ¥60,000 |
※標準納期はサンプル受領後の期間となります。
報告内容
解析なし： シーケンス生データ 解析あり： ①シーケンス生データ ②マッピングとカウント結果 ③各種解析結果と解析レポート
オプション
| スタンダード解析Plan | アドバンス解析Plan | カスタマイズ解析Plan |
|---|---|---|
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1. データQC 2. リードマッピング 3. リードカウント 4. FPKM値/TPM値算出 |
1. スタンダード解析 2. 相関分析 3. 主成分分析 4. 階層的クラスタリング 5. ヒートマップ描画 6. 変動遺伝子解析(MA plot, Volcano plot) 7. Gene Onthology(GO)解析 |
パスウェイ解析、融合遺伝子解析、 Transcript SNP解析、 de novo transcriptomeなど、 ご要望に応じて各種対応します。 |
※ヒト・マウス以外のデータ解析については対象生物ゲノム情報の提出・指定などご相談になります。