Revio™システム

製品説明

〇 Vega™システム 　◆ロングリードシークエンシング◆ ・PacBio初のベンチトップロングリードシークエンサー ・50-60Gb/SMRT cellの出力 ・最大200ヒトHiFiゲノム(x20)/年を解析 ・ラージスケール：2,500ヒトHiFiゲノム / 年 ・フレキシビリティ：500ngのDNAインプット量と柔軟なラン設定 ・演算能力：Google DeepConsensus等を搭載 ・コストメリット：従来の1/3の消耗品コスト ＜生物のより完全な理解へ＞ 〇フェージングおよび 5mC+6mAを用いたより包括的なバリアントコール 一塩基多型、Indel、構造多型、タンデムリピート伸長、メチル化など、困難な領域を含むすべてのバリアントタイプに対して高い精度が得られます。 〇複雑なゲノムの真に完全なアセンブリ テロメアやセントロメアを含む染色体中の全塩基配列を正確に構築します。 〇ターゲットシークエンシングで大規模な遺伝子研究 PureTarget™、ハイブリッドキャプチャやPCR 増幅による関心領域のエンリッチメントでHiFi バリアントコールの 威力を発揮させます。 〇シングルセルトランスクリプトーム解析 シングルセルトランスクリプトームを遺伝子のカウントからシングルセルレベルのRNAアイソフォームカタログ化へと進化させます。 ＜最も正確なリードを迅速に＞ 〇Revio™システムは、最先端のNVIDIA GPUを搭載し、Sequel IIeシステムと比較して20倍超の演算能力を持ちます。 〇このGPU はRevio™システムにおけるシークエンシングのスループットに対応して、ベースコールとHiFiリードの生成を高速に行います。 〇Google DeepConsensus を搭載したRevio™は、これまでで最も高い精度を提供するPacBio®ロングリードシステムです。DeepConsensusは高度な深層学習技術を用いており、HiFiシークエンシングの精度と収率をさらに向上させます。

製品概要

＜Revio™システムを用いたHiFiシークエンシングによる解析＞ 〇ロングリード 数万塩基の長さを持つHiFiリードによって、構造多型やタンデムリピート伸長など大きなバリアントについての解明や、通常は難しいゲノム中の反復配列へのマッピングが可能です。 〇卓越した精度 HiFiシークエンスでは、90%の塩基が≥ Q30、リード精度の中央値が≥ Q30 という優れた精度により信頼性の高い結果が得られます。 〇ネイティブなDNAからのメチル化の直接検出 HiFiシークエンシングでは、バイサルファイト処理なしに、いつでもDNAのメチル化を塩基対レベルで同定できます。 〇配列中のコンテクストを問わず均一なカバレッジ 最適化されたポリメラーゼを用いた、増幅を伴わないHiFiシークエンシングにより、高GC領域やタンデムリピートに対しても均一なカバレッジが得られます。 〇低いDNA投入量 各サンプルに必要なインプットDNA量はわずか500ngであり、Revioシステムで最も貴重なサンプルのHiFiシーケンスも可能です。 ＜Revio™システムでHiFiシークエンシングをさらに魅力的に＞ 〇HiFiシークエンシングの良さはそのままに ・ネイティブDNA分子の長く精密なリード ・手動と自動化システムに対応した容易なライブラリ調製方法 ・装置上での HiFi リード生成、メチル化コール(5mCと6mA)、デマルチプレックス ・下流工程の解析ツールに対応した標準的なBAMファイルフォーマット 〇Revio™システムでさらに得られること ・ハイスループット ― 最大 2,500 HiFi ゲノム / 年 ・500ngのDNAインプット量 / サンプル ・必要な消耗品の少なさや迅速なセットアップ、Adaptive loading、リアルタイムランパフォーマスプレビューなど、シンプルな使用性 ・Google DeepConsensus 搭載でこれまでで最も正確なHiFiリード ・出力ファイルが半分のためストレージコストを削減

仕様

・W×D×H：92.7×91.4×174.5cm ・重量：465 kg ・電源：200～240 VAC、50～60 Hz、30A

備考