LC/MS/MSを用いた非標識プロテオミクス
プロテオミクスの研究者が最新技術を用いて最高の解析結果をお届けします
サービス概要
メディカル・プロテオスコープ社による、プロテオミクスサービスです。 プロテオミクスの第一歩は、対象の生物系に含まれているタンパク質群の発現量や翻訳後修飾の変動を計測することです。この網羅的な分析を効率よく進めるため、メディカル・プロテオスコープでは、液体クロマトグラフィー (Liquid chroma- tography, LC) とタンデム質量分析 (Tandem mass spectrometry) を連結した質量分析システム (LC-MS/MS) を最適化しています。 非標識法の利点 非標識LC-MS/MSには以下の特長があります。 ・試料調製の手順が単純。 ・微量試料にも適用しやすい。 ・比較的安価で実施することができる。 ・比較に供する試料の数に上限がないので、研究の目的と規模に合わせて最適の分析計画を立てることができる。 非標識LC-MS/MSを活かした分析例 次のような研究に最適です。 ・培養細胞において、薬剤の曝露によるタンパク質発現の変動を調べる。 ・ブルダウン精製物のタンパク質組成の違いを計量比較する。 ・細胞から培養液に分泌・漏出されるタンパク質群を同定する。 ・生産抗体の各種修飾や生産宿主由来の混入タンパク質群をロット毎に分析する（バイオ医薬品の品質管理）。
LC-MS/MSを用いたプロテオーム間の計量比較 ショットガンLC-MS/MSによって、イオン化したペプチド分子の質量スペクトルと、各ペプチドの開裂で生じたイオン（生成イオン）の質量スペクトルがともに大量に得られます（図1）。 前者で観測されたピークの検出強度は当該ペプチドの含有量を反映しています。後者の生成イオンスペクトルはペプチドのアミノ酸配列の情報を含んでおり、このデータから配列データベース検索によるペプチド/タンパク質の同定へと進みます。
非標識 (Label-free) LC-MS/MSの原理 各試料から個別にLC-MS/MS測定データを取得します。各測定データに含まれる、ペプチド断片のイオン検出情報を試料間で対応付け、これをもとにして各ペプチドの同定情報と計量値を統合します（図2）。
サンプル種類
分析の対象・培養細胞・組織試料・培養上清・プルダウン精製試料・血漿/血清・バイオ医薬品（抗体など）・エクソソーム、細胞外小胞など多数。報告内容
各試料から個別にLC-MS/MSデータを取得します。各データに含まれる、ペプチド断片のイオン検出情報を試料間で対応付け、これをもとにして各ペプチドの同定結果と計量値を統合します。
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