メタトランスクリプトーム解析
微生物叢の“機能”を、まるごと読み解く
サービス概要
糞便や土壌など様々な微生物が混在するサンプルのtotalRNAからrRNAを除去し、次世代シーケンスで試料中の微生物叢の網羅的な遺伝子発現解析を行います。 サンプルからのRNA抽出からデータ解析まで柔軟なご依頼が可能なサービスです。 4検体以上でのご依頼でスタンダード解析が無料に！
サービス種類
| メニュー | データ量／リード数 | 標準納期※ | サンプル要件 | 価格（税別） |
|---|---|---|---|---|
| メタトランスクリプトーム (rRNA除去) | 6Gb／40M read | 30営業日 | 濃度50ng/μL以上で≧20μL以上 (総量：1μg以上) RIN値≧7推奨 | ¥46,000 |
| メタトランスクリプトーム (rRNA除去・RNA抽出) | 35営業日 | 糞便：0.3 g程度 唾液：1 mL程度 その他もご相談ください | ¥64,000 |
※標準納期はサンプル受領後の期間となります。
報告内容
解析なし： シーケンス生データ 解析あり： ①シーケンス生データ ②マッピングとカウント結果 ③各種解析結果と解析レポート
オプション
| スタンダード解析Plan | アドバンス解析Plan | カスタマイズ解析Plan |
|---|---|---|
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1. データQC 2. リードマッピング 3. リードカウント 4. FPKM値/TPM値算出 |
1. スタンダード解析 2. 相関分析 3. 主成分分析 4. 階層的クラスタリング 5. ヒートマップ描画 6. 変動遺伝子解析(MA plot, Volcano plot) |
パスウェイ解析、融合遺伝子解析、 Transcript SNP解析、 de novo transcriptomeなど、 ご要望に応じて各種対応します。 |
※ リファレンス等もご相談ください。