プロテオームデータ解析サポート

サービス概要

メディカル・プロテオスコープ社による、プロテオームデータ解析サポートサービスです。 現在のプロテオミクスが取り扱う情報の量は、質量分析計や各種分離技術の発展に伴ってますます膨大になっています。メディカル・プロテオスコープ社では、受託分析を通じてプロテオームの測定データを処理・解析するためのノウハウを蓄積しています。単なるタンパク質同定計量一覧の提供にとどまらず、適切な解析ソフトウェアを用いて重要な候補タンパク質の「見える化」をサポートします。

サンプル種類

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サービス種類

おもなデータ処理・解析の項目・アミノ酸配列データベース検索:MS/MSデータとアミノ酸配列情報との照合によってペプチド/タンパク質を同定します。各同定情報の信頼性も数値化します。【使用ソフトウェア】SEQUEST HT（サーモフィッシャー）・LC-MS/MSデータの整列化と統合(非標識法の場合):複数のLC-MS/MSデータに含まれるペプチドピーク情報を検出・整列化します。整列化処理によって、LC-MS/MSデータ間でピーク強度を相互に比較することが可能になります。【使用ソフトウェア】Proteome Discoverer 3.0（サーモフィシャー）・ペプチド/タンパク質の定量:選択的反応モニタリング (Selected reaction monitoring, SRM/MRM) や並行反応モニタリング (Parallel reaction monitoring, PRM) などの定量質量分析によって取得した測定データを解析します。試料に添加した安定同位体修飾ペプチドの検出とともに、対象ペプチドの定量値を効率よく出力します。【使用ソフトウェア】Skyline (MacCoss Laboratory)・同定計量情報の統計解析と視覚化:各種ソフトウェアから出力された同定計量情報を統計解析に供し、解析結果を様々な形式で図示します。【使用ソフトウェア】Perseus (Max Planck Institute)

解析法

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報告内容

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納期

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