ロングリード全ゲノム解析（PacBio）
PacBio Revioによる高精度ロングリードシーケンス
サービス概要
PacBio Revioを用いて、ロングリードシーケンスで様々な生物種の全ゲノムを解析します。 ショートリードでは解析困難な長いリピート配列や構造的変異の解析、高度に変異する領域をより正確に解析できます。DNA抽出～データ解析まで一気通貫でご対応します。 取得データ量は、推定ゲノムサイズの20-30倍が目安です。解析対象に合わせたデータ量プランをご提供します
従来のショートリードシーケンスによるアセンブルでは多数のContigとギャップ(隙間)ができていますが、 HiFi-readではショートリードと同程度のデータ量で完全長のゲノムが構築されました。 完全長ゲノム配列獲得を目指す上でHi-Fi readは非常に有効なツールになります。
サービス種類
| メニュー※1 | 作業内容 | 納期 | 価格（税別） |
|---|---|---|---|
| 300Mb（原核生物向け） | 1. DNA抽出※1 2. ライブラリ調製 3. シーケンシング 4. 基本データ解析 | 約40営業日 | ¥150,000 |
| 1Gb | ¥210,000 | ||
| 5Gb | ¥350,000 | ||
| 10Gb | ¥400,000 | ||
| 20Gb | ¥500,000 | ||
| 30Gb | ¥550,000 | ||
| ライブラリシーケンス （1セルあたり：50〜90Gb） | ライブラリ調製（1検体分※）、 シーケンシング | 約40営業日 | ¥800,000 |
※ 複数サンプルを1セルにシーケンスする場合は、追加検体ごとのライブラリ調製費用をいただきます。
※1 シーケンスデータ量はDNA品質・サンプルにより変わるため、データ量の保証は行っておりません。
※2 サンプル種によっては応相談になります。
備考
【サンプル要件】
| サンプル種 | 推奨要件量 |
|---|---|
| 微生物株（原核生物・真核生物） | 細胞数：5×109 cells、（湿重量100 mg以上） |
| DNAサンプル | 濃度30 ng/µL以上を50 µL以上（総量1.5 µg以上） |
| 微量DNAサンプル | 総量（300–1 ngまで相談可） |